Consciente da valia ambiental do transporte ferroviário e da rede que o sustenta, a Política de Ambiente da REFER assenta nos princípios da prevenção, da mitigação e da compensação dos seus impactes.
Este compromisso estende-se a diferentes áreas de intervenção como o ruído, a gestão dos resíduos ou a conservação da natureza e a promoção da biodiversidade.